مسجد آقا بزرگ کاشان طی سالهای 1250 تا 1260 هجری قمری با سرمایه حاج محمدتقی خانبان ساخته شد و از آن برای برگزاری نماز جماعت، برگزاری مجالس درس و بحث دامادش ملا مهدی نراقی دوم برادر احمد نراقی ملقب به آقا بزرگ بنا شده است. این بنای تاریخی که مسجد و مدرسه بوده است در منطقه تاریخی شهر و بافت کهن کاشان قرار داشته و در کنار مقبره خواجه تاج الدین واقع شده است. ساختمان این مسجد از نظر استواری وضعیت مطلوبی دارند، همچنین تلفیق فضای قدیمی مسجد وارانه که دارای شبستان و... است با مدرسهای که در این منطقه قرار دارد فضای بسیار زیبا و منحصر به فردی ایجاد کرده اند که این زیبایی به خصوص در ایجاد هماهنگی در اتصال این بناهای تاریخی به هم بوده است. البته گفتنی است که یکی از مهمترین قسمت هایی که بعد از ساخت به این مسجد اضافه شد، یعنی 40 ستون غربی گنبدخانه؛ به معماری این بنای تاریخی لطمه زده است.