موزه تجارت دریایی خلیج فارس یکی از آثار مربوط به دوران قاجاریه محسوب می شود و در نزدیکی اداره دریانوردی بوشهر واقع شده است. این موزه با بیش از یک قرن قدمت چندین حوزه گوناگون را شامل می شود.
مهم ترین آثار موجود در موزه تجارت دریایی خلیج فارس شامل پژوهش هایی در زمینه تجارت دریایی خلیج فارس، اسناد دریایی این خلیج، یک کتابخانه در ارتباط با دریانوردی، اسناد حاکمیت خلیج فارس و همچنین یافته های باستان شناسی از زیر آب مانند ظروف سفالی می شود. ضمن اینکه در این موزه می توانید تصاویری از مشاغل قدیمی مردمان بوشهر و همچنین تصاویری از لنج سازی این شهر را ببینید.