امامزاده اسماعیل خمین در ۱۰ کیلومتری شمال غربی شهر خمین واقعشده و در روستای بوجان قرار دارد، و یکی از چندین امامزادهای این شهر میباشد. ساختمان این امامزاده بهصورت چهار ضلعی است که هر ضلع آن ۹۰.۶ طول دارد و در وسط هر کدام از این زلزلهها درگاهی با عمق زیاد قرار گرفته است. برای اینکه شکل گنبد بهصورت متعارفی دربیاید، طرح چهار ضلعی ساختمان به یک طرح هشتضلعی تبدیلشده است، همچنین قسمت داخلی گنبد جان را طاقنما مینامند دارای نورگیر های مشبک چوبی است که تنها تزئینات داخلی این بقعه بهحساب میآیند. ۴ در ورودی این آرامگاه چه در دوران صفویه ساختهشدهاند با مشبککاری و گلوبوتههای اسلیمی تزیین شدهاند.